Skip to content

Drugi pandemiczny szczep Vibrio cholerae z epidemii cholery z Filadelfii w 1849 roku

1 miesiąc ago

415 words

W XIX wieku doszło do kilku poważnych pandemii cholery na subkontynencie indyjskim, w Europie i Ameryce Północnej. Przyczyny tych epidemii i tożsamości szczepów genomicznych pozostają tajemnicą. Wykorzystaliśmy ukierunkowane sekwencjonowanie o wysokiej wydajności do rekonstrukcji genomu Vibrio cholerae z zachowanego jelita ofiary epidemii cholery w 1849 roku w Filadelfii, będącej częścią drugiej pandemii cholery. Ten szczep biotypu O1 ma 95-97% podobieństwa do klasycznego genomu O395, różniącego się od 203 polimorfizmów pojedynczych nukleotydów (SNP), pozbawionych trzech genomowych wysp i prawdopodobnie posiadających jedną lub więcej macierzy tandemowej toksyny cholery (CTX), które potencjalnie jego zjadliwość. Ten wynik podkreśla zarchiwizowane pozostałości medyczne jako potencjalne źródło informacji dla genomowych źródeł przeszłych pandemii.
Wprowadzenie
Cholera jest chorobą biegunkową spowodowaną przez kolonizację jelit przez szczepy bakterii jelitowej V. cholerae wytwarzające toksynę cholery. Ognisko może nagle wybuchnąć, szczególnie w podatnych na zagrożenia populacjach z zagrożoną infrastrukturą sanitarną, tak jak podczas niszczycielskiej epidemii w 2010 roku na Haiti.1 W samym tylko 2012 roku V. cholerae zainfekowało 3 miliony do 4 milionów ludzi, zabijając prawie 100 000. Chociaż wszystkie patogenne szczepy V. cholerae posiadają podobny szkielet genomowy, który mógł ułatwić adaptację do śluzówki jelita ludzkiego, 3,4 dominujący szczep patogenny, serogrupa O1, posiada dwa genetycznie odrębne biotypy: klasyczny i El Tor (opisy tych i innych terminów znajdują się w glosariuszu). W XX wieku, z niewiadomych przyczyn, El Tor zastąpił klasyczny jako dominujący biotyp. Od 187,17,5 lat odnotowano siedem udokumentowanych pandemii, ale przyczynowo-skutkowe szczepy V. cholerae zostały scharakteryzowane genetycznie tylko dla dwóch ostatnich ognisk. Dlatego, chociaż większość zakłada, że klasyczny biotyp był odpowiedzialny za wcześniejsze pandemie, 6 tożsamość szczepów, które je wywołały, pozostaje nieznana.
Rysunek 1. Rysunek 1. Historyczna próbka jelitowa. Panel A pokazuje okaz 3090.13, zachowaną część jelita od 1849 ofiarą cholery. Próbka została zebrana przez dr. Johna Neilla i jego współpracowników w celu zbadania wpływu cholery na wyściółkę jelitową. Ich raport z 1849 roku został przedstawiony Kolegium Lekarzy w Filadelfii, a okazy zostały wystawione, później stając się częścią zbiorów Muzeum Mütter. Panel B pokazuje przykłady szkiców histologicznych i morfologicznych uszkodzeń jelit, które towarzyszyły raportowi; po lewej jest szkic struktury kosmków, a po prawej szkic kosmków o większym powiększeniu z widocznymi wstrzykniętymi kapilarami.
Różne próbki tkanek archiwizowane przez lekarzy w momencie wybuchu stanowią zasadniczo niewykorzystane muzeum genetyczne do badań nad patogenami
[patrz też: kurs dla fizjoterapeutów, przetargi medyczne, kursy fizjoterapia ]

Powiązane tematy z artykułem: kurs dla fizjoterapeutów kursy fizjoterapia przetargi medyczne