Skip to content

Drugi pandemiczny szczep Vibrio cholerae z epidemii cholery z Filadelfii w 1849 roku AD 4

5 dni ago

440 words

Prawdopodobne jest również posiadanie tych samych pozycji CTX co szczep O395, ponieważ wydaje się, że ma identyczne chromosomalne regiony flankujące, chociaż obserwowane przy małym pokryciu. Jednak jego konfiguracja proponu CTX, która różni się między szczepami, 4,17 nie zaobserwowano dotychczas w klasycznych szczepach; odczyty odczytu wskazują, że istnieje powtarzalny zakres powtórzeń CTX (rys. S8 i S9…

Drugi pandemiczny szczep Vibrio cholerae z epidemii cholery z Filadelfii w 1849 roku AD 3

5 dni ago

416 words

Zatwierdzenie etyki do badania uzyskano z Hamilton Health Sciences i McMaster University. Wyniki Historyczny genom V. cholerae Rekonstruowaliśmy projekt genomu V. cholerae (PA1849) na przeciętnej wyjątkowej głębokości pokrycia 15,0 ×, zawierającej 94,8% szczepu referencyjnego O395 o pokryciu co najmniej 1,0 × i różniącym się od 203 SNP (patrz Dodatek 2).

Drugi pandemiczny szczep Vibrio cholerae z epidemii cholery z Filadelfii w 1849 roku

5 dni ago

415 words

W XIX wieku doszło do kilku poważnych pandemii cholery na subkontynencie indyjskim, w Europie i Ameryce Północnej. Przyczyny tych epidemii i tożsamości szczepów genomicznych pozostają tajemnicą. Wykorzystaliśmy ukierunkowane sekwencjonowanie o wysokiej wydajności do rekonstrukcji genomu Vibrio cholerae z zachowanego jelita ofiary epidemii cholery w 1849 roku w Filadelfii, będącej częścią drugiej pandemii cholery. Ten szczep…